アプリケーションフォルダ＞ユーティリティ＞Audio Midi設定 を開きます.

オーディオ装置の「Universal Audio Thunderbolt」を選び、
Control +クリック（または右クリック）でこのサウンド出力装置を使用を選ぶと Apollo の「Main Out」からシステム音が出るように設定します

Virtualチャンネルを介してVolumeコントロールしたい場合

「スピーカーを構成」をクリックし
左フロントを Virtual 1
右フロントを Virtual 2
に設定します。

ApolloConsole の Virtual I/O でミュージックの音量を設定できます